庾亮到了寻阳，与温峤会面后，两人激动地抱在一起，热泪盈眶。
庾亮流着眼泪说：“朝廷损兵折将，连连失败，这都是我的罪过啊！我对不起先帝的信任，愧对他的重托啊！”
温峤说：“元规不必过于自责，况且现在也不是追究责任的时候。我们眼下要做的是如何稳定军心，彻底消灭叛军，取得最后胜利。”
庾亮说：“嗯，温太真言之有理。我来时，带来了太后的诏书。现在请温峤接诏。”
温峤急忙跪下。
庾亮继续说道：“宣太后诏：任命温峤为骠骑将军、开府仪同三司；加郗鉴司空。”
温峤答道：“谢太后恩典！但是请恕臣无礼：苏峻之乱未平，温峤不能接受这一任命。”
庾亮说：“太真请起。有话慢慢说。”
温峤站了起来，从容说道：“那些乱臣贼子还没有肃清，我有什么脸面和资格升迁呢？我们应该抓紧联合各地的军队，共同抗击苏峻、祖约的叛军。我这里有几万兵马，我现在拿出一半来交给你指挥。另外，咱们联合各地的军队，也该推举一个盟主。依我看，盟主之位，非你莫属啊！”
听了温峤一席肺腑之言，庾亮激动地热泪盈眶。但他还是坚定地摆了摆手拒绝道：“感谢你对我的信任，不因为我的重大失误抱怨我，嫌弃我，还重新分派给我军队让我掌握指挥权。但是你也看到了，我指挥失当，没有军事天分和经验。所以我来这里找你，就是想当杀灭叛贼、报仇雪耻的普通一兵，别提什么指挥军队，更甭提让我当什么盟主了。我建议，盟主之位，由你担任最为合适。这也肯定是众望所归啊。”
两人互相推让了半天，也没个结果。
这时候，一旁温峤的弟弟温充提出建议：“你们两位不必推来让去的了。你们两个谁担任盟主都不合适！”
庾亮愣了，急忙转脸问道：“那你说谁合适呢？”
温峤连忙介绍说道：“这是我弟弟、参军温充。”然后也问温充，“我两个都不合适，那你说吧，谁才合适当联军盟主呢？”
温充说道：“陶侃最合适。陶侃是个老将，所处的荆州战略位置非常重要，而且他的手下兵强将勇。这个时候，你们两个都必须采取高姿态，把这个盟主之位让给陶侃，争取他出兵才是上策。”
这时候庾亮、温峤如梦初醒，恍然大悟。说道：“对啊，那现在就马上给陶侃写信让他出兵，担任联军盟主吧。”
于是两人共同推举征西大将军陶侃担任盟主，并派督护王愆期到荆州通知陶侃。
陶侃听督护王愆期说了他的来意，看了温峤、庾亮写给他的信件，但是仍然对自己没有被任命为辅政大臣对庾亮及朝廷耿耿于怀，所以陶侃一口回绝了。
陶侃说：“我陶侃只是一个边城守将，并没受到先帝托孤之重托。不但不被朝廷看重，而且深受朝廷怀疑。现在有了国难，又突然想起微臣来了。我这里兵微将寡，本人昏聩无能，哪里胜任得了联军主帅呢？还是希望温将军、庾将军、王督护另请高明吧。”
王愆期哪里还敢再说下去呢？只好怅怅而归。
后来温峤又接连派出去四、五个人给陶侃联系，陶侃虽然看起来有些犹豫，但都拒绝了。
温峤对庾亮说：“既然陶侃这么怨恨朝廷，不肯出兵，那咱们就最后给他去信通知他：你不参与讨伐，我们就不再等你了……”。
信已经送出去两天，正好温峤的参将毛宝从别的地方出使回来，听说了这件事，他对温峤说：“凡是举大事，应当尽可能团结更多的人一起行动，而众人要一起行动全在于团结，没听说互不同心能成功的。假如互相之间有疑虑，也应当表面上装作不知道，怎么能在内部之间制造疑虑呢！应该赶紧追回信使，修改原来的信，劝说他一定要一起征讨。如果追不上前面的信使，就应当再派使者另写一封信纠正一下。”
温峤猛然醒悟。于是温峤就追回使者并再次修书，继续痛陈利弊。精诚所至金石为开，陶侃终于答应起兵担任盟主，并派督护龚登领兵与温峤会合。温峤、庾亮于是传檄天下，宣告苏峻、祖约的罪状。
驻守广陵的郗鉴“革命”积极性非常高涨。他向温峤派出使者，提出设立堡垒、坚壁清野、断绝苏峻军粮食来源的策略，温峤深表同意。
但是没过几天陶侃却又反悔并追还龚登。
见此情景，温峤只有再度向陶侃写信劝说。恰巧这时，陶侃的儿子陶瞻在与苏峻、祖约叛军作战时被祖约的大将冯铁杀死。温峤在信中以其儿子陶瞻被苏峻叛军杀死的信息刺激陶侃，最终才令陶侃感悟，于是不顾儿子的葬礼，昼夜兼程，亲自领兵前来与温峤会合。
而徐州刺史郗鉴所在的广陵粮少城孤，邻近北方外族政权，故此士民都无坚定守戍的意志。但郗鉴收到庾亮给他的太后懿旨，获知自己升任司空的诏书后当即感激流涕，“革命”积极性被充分调动起来。他迅速召开军民誓师大会，号召起兵讨伐苏峻，将士都争相要求参与。然后率兵向茄子浦开拔。
陶侃大军到寻阳与温峤合兵一处。众人都议论纷纷：
“陶侃要杀庾亮以谢天下了。”
“苏峻、祖约就是以杀庾亮为名起兵的，这样做，岂不是帮了他们的忙了？”
“新账老账一起算呗，怕是要追究这次朝廷军队节节败退的责任吧？”
“庾亮这回够受的。”
听了军民的一些街谈巷议，庾亮也感到十分恐惧了。
温峤提议：“既然是陶侃已经过来了，咱们就主动到他那里去拜访一下吧。”
庾亮感到害怕，说：“说实在的，我是有几分胆怯啊！”
温峤说道：“怕什么啊？有我呢。非常时期，我想他陶侃是会顾全大局的。”
庾亮说：“其实我也没什么对不起他的啊，只是以往对他缺乏信任而已。”
温峤说：“即便你在朝堂采取一些措施，也是为国家着想，并没对他本人形成伤害。再说，顾命大臣的事情，他即便埋怨你也只是个误会，因为要谁当顾命大臣不是你元规能决定的。”
于是庾亮只好硬着头皮跟着温峤前去会见陶侃。
进到陶侃的将军大帐，温峤、庾亮跟陶侃一打照面，互相介绍已毕。
只见庾亮冷不防从容跪倒在陶侃面前，说道：“陶将军，元规给你赔罪来了！以往元规刚愎自用，不听众臣之良策，导致朝廷军队节节失利。国家罹难，百姓遭殃，这都是元规一人之罪啊。罪臣元规作为带罪之身，肯请陶将军作为联军主帅，带领联军讨伐叛逆。只要讨逆成功，罪臣何惜这一项上人头呢？那时定当以此向天下谢罪！”
陶侃一看庾亮玉树临风，气质不凡，突然间玉树倾倒，拜倒在自己面前，而且态度诚恳，悲悲切切，心里的怨恨恨恼怒似乎一下子都飞到九霄云外了。
陶侃急忙扶起庾亮，说道：“庾将军言重了。国家有难，不只是你一人之过啊。”
庾亮含泪说道：“元规对不起先帝和太后，对不起皇帝，也对不起众位大臣和百姓啊。”
陶侃见庾亮果然风流儒雅，气度不凡，顿生好感，但是嘴里却还是不依不饶地对庾亮带有讽刺意味地说：“君侯修石头（即修建康城）以防我，今日为何却反过来求我呢？”
庾亮说：“以往确实是我元规没有识人之慧眼，做事不当，所以导致今日朝廷被动，朝局动荡不安，万千之错，都是我一人知错，请陶将军责罚便是。”
陶侃哈哈大笑：“君侯太过自责了。大敌当前，咱们必须共同对敌，就不信他苏峻和祖约能够翻天！”
这时温峤急忙插话：“今日咱们几路大军会合一处，自当同心协力，争取早日取得平叛胜利。今天，我温太真略备薄酒，为咱们联军盟主接风洗尘。”
于是温峤设宴招待。几个主将谈宴终日，庾亮、陶侃之间的隔阂逐渐消除，气氛开始趋于融洽。
庾亮在吃荞头的时候，根须都放在一边，没有丢弃。
陶侃问道：“你留这个有什么用呢？”
庾亮回答说：“这个还可以种啊。”
陶侃闻听赞叹良久，说：“没想到，庾元规不仅仅风流蕴藉，儒雅潇洒，而且确实具有从政的素质啊。”更加欣赏庾亮。
讨伐军于是齐心要进攻建康，平灭苏峻，这便形成了“西军”。不久便起兵。
同时王导以太后密令要三吴吏士起义兵援救建康。会稽内史王舒于是命早前逃亡到当地的庾冰担任奋武将军，领兵渡过浙江，吴兴太守虞潭、吴国内史蔡谟和前义兴太守顾众都举兵响应。至此三吴的“东军”也起兵了。
苏峻知道陶侃领导的西军起兵后，非常吃惊，他不得不心悦诚服地说：“我早就估计到温峤很能得人心啊！”
苏峻听从参军贾宁的计谋，由姑孰退守石头，分兵对抗西军各部。而派管商、张健和弘徽等对抗东军。与虞潭互有胜负，相持不下。
这时苏峻也逼迫成帝迁到石头城。成帝之母、庾亮的妹妹庾太后不堪忍受苏峻将士的侮辱，自杀身亡。
毛宝受命率领一千人作温峤的前锋，驻扎在茄子浦。正好遇见了一桩“大买卖”。原来毛宝派出去的探子回来报告说：“苏峻送给祖约军队一些粮食，祖约的司马桓抚接受了这些粮米，正在向这里走来，看来茄子浦是他们运粮队伍的必经之地。”
毛宝一听非常高兴：“这送到嘴边的肥肉，不吃白不吃啊，他们有多少人啊？”
探子说：“看来人不少，大约一万多人吧。”
毛宝作难了——是啊，人数悬殊太大，一千对一万，太冒险，如果己方的人数再多点儿，感觉就保险一些……
没想到，正打瞌睡呢有人就送来了枕头，需要人手呢，还真来了很多帮手——郗鉴随后率众渡江也来到了茄子浦，正是来与温峤军队会合的。
这时候士兵们仍有顾虑，因为要想去劫粮，就必须上岸去打伏击战，但是士兵们却都不敢随便上岸。这是因为当初，温峤认为南军熟悉水战，苏峻军善于步战，想用己之长制彼之短，就宣令三军：“有上岸者处死。”
于是毛宝就对部下说：“兵法上说：军令有所不从。现在情况变了，哪能不上岸呢！如果温将军要拿军令处罚大家的话，就由毛宝我自己承担罪责好了！”
这样就打消了兵士们的顾虑，采用变通之办法率领兵士打了个漂亮的伏击战，成功袭击了祖约的司马桓抚，夺取全部米粮一万斛米，并俘虏斩杀一万多名贼军，令祖约更加缺粮，祖约军队因此大饥。
温峤得知这一喜讯，十分高兴。他嘉奖了毛宝的功勋，上表任命他为庐江太守。
之后温峤就与陶侃以水军直指石头城。
苏峻当时见到在查浦的陶侃军和沙门浦的温峤军兵士众多，显得有些畏惧。
但另一方面，在广德的桓彝显得孤立无援，周边郡县都向苏峻投降，但桓彝坚决不降，后被韩晃击败并围困，最终因城陷桓彝被杀。
东军方面，苏峻开始打算以赦免庾亮诸弟以取悦众心，但仍派张健、管商、弘徽等人进攻。起初东军虽有小胜，管商等进攻吴郡，焚烧了吴县、海盐、嘉兴，打败了诸路义军。
管商等又焚烧余杭，也焚毁了刚建成的灵隐塔寺。但在武康被官军打得大败，退守义兴。
但后来庾冰与顾飏皆被张健击败，令吴郡郡城被张健所掠。顾众与虞潭后也被管商击败，分守吴兴及柴辟。后虞潭再于吴兴战败，吴兴郡的东迁、余杭和武康都因其军败退而被苏峻军抢掠。虞潭派往吴县的督护沈伊亦败于管商。抵抗形势很不乐观。
西路讨伐军逼近石头城时就打算作一次决定性战役，但陶侃认为苏峻兵强难以争锋，打算进行持久战并以智谋击败他。后因多次交战都无大成果，便筑白石垒固守，由庾亮领二千守军据守。不久苏峻以万人来攻，庾亮带领将士死打硬拼，顽强抵抗，苏峻仗着人多也不能攻破。陶侃于是命郗鉴和郭默还驻京口，建大业、曲阿和庱亭三垒分散苏峻军力。
祖约发现桓宣带领部下悄悄脱离了自己，便派遣祖涣和桓抚追击，追到马头山。同时祖约也让祖焕、桓抚他们袭击湓口的陶侃，而马头山在去往湓口的途中。
陶侃要亲自迎战，毛宝说：“义军都依赖陶公，杀鸡焉用宰牛刀？陶公不可轻动，就让我带兵去征讨如何呢？”
陶侃禁不住对毛宝另眼相看。他对座中宾客夸赞说：“这个年轻人不简单啊，他的话可以采用。”于是就派毛宝去了。
此时，桓宣被祖涣、桓抚等人攻击，便派人下山向毛宝求救。毛宝手下人认为桓宣本来就是祖约的人，怀疑他。于是桓宣派他的儿子桓戎再来求救，毛宝就跟着桓戎去救援。毛宝率兵赶到，贼军与桓宣激战正酣。桓宣已经明显招架不住了。
毛宝军远离后方兵力薄弱，军械质量低劣，但毛宝勇猛上阵，率领将士拼死一战，终于赶跑了贼军，解救了桓宣。毛宝所带军士伤亡大半，毛宝自己也中了一箭，箭穿过大腿钉入马鞍，让人踏着马鞍才把箭拔了出来，血流满靴。
毛宝领兵救援并成功击败对手，使得桓宣解困并投归温峤。此后毛宝又于东关与祖约作战，攻破了合肥城。
令祖约没想到的是，他的下属将领竟暗中勾结后赵，作为内应。
后赵于是派石聪和石堪渡过淮河进攻祖约守卫的寿春。里应外合之下，祖约被后赵军击败，逃奔历阳，而后赵军则俘虏胁迫着寿春二万多户人北归。
苏峻的心腹路永、匡术和贾宁知道祖约兵败后都感到害怕，于是劝苏峻尽诛大臣，改立自己的心腹为朝廷大员。但苏峻敬重王导，不肯接受。路永等因而对苏峻不满。
王导一看叛军里边起了内讧，感觉有机可乘，便派参军袁耽劝说路永归顺。王导及后试图靠着路永救出成帝投奔义军，但因守备森严而失败，王导于是带二子与路永逃到白石。
讨伐军与苏峻军相持不下，而苏峻分遣诸将四出攻掠，擒获很多，军威日渐强盛，战无不克，因此陶侃、温峤的义军士气低落，部众多怀有异心。
朝中大臣很多赶来投奔来义军的，相互转告说：“苏峻狡猾奸诈智谋多，他的将士也很骁勇，所向无敌。应当以天子的名义讨伐罪人，要想诛灭他恐怕要用一个时期；若是凭义军的抵抗，不易剿除。”
温峤听了这话，十分恼怒，说道：“你们都是胆小鬼，这是长贼人的志气，灭义军的威风啊！”
但此后温峤始终无法击溃苏峻军，反倒军粮用尽。别无他法，温峤只好提出向陶侃借粮。
此举却令陶侃十分不满。他说：“我早就说过，对付这些叛军不是短期内能成功的，现在咱们接连吃败仗，你的军粮也用完了。我看就算了吧，打不赢，暂时可以休战。我要退回荆州慢慢跟叛军打消耗战了。”
温峤一看陶侃气馁了，又不想借给他军粮。便说：“汉光武帝在昆阳之战和曹操于官渡之战中不是都以寡敌众，先败后胜的吗？原因很简单，这都是因义而胜。现在苏峻因小胜必定骄傲，咱们正好可以利用他这一心理，打他个冷不防，一次挑战就可一鼓而擒之。”
陶侃听了犹豫不决。
毛宝一看这陶侃想就这样率众退回去，便对温峤说：“下官能留住他。”
然后毛宝就去对陶侃说：“此仗打到现在，可以说是中途，也可以说是功亏一篑。如今犹如骑虎，不能中途下来，若陶将军违反了众意返回荆州，咱们的联军必定会失望丧气，其结果那肯定是要兵败，那最后的不义之名就会落在陶将军一人身上啊。贼人也怕死，不是每个人都勇敢，陶公可以试着给我一些部队，让我上岸去切断贼军的物资粮草，出其不意，使贼军困顿。如果我不能成功，然后将军再走，人们心中就没有遗憾了。”
陶侃听了听，感觉在理。便提升毛宝为督护，并说：“我可就看你的了，如果你不能切断贼军粮草，我还是会带兵退到荆州的。”